王石离开万科的原因是多方面的，主要包括以下几点：

股权布局失误：

王石在上市前过度稀释自己的股权，以换取更多资金，但没有进行特殊股权布局，导致其在决策上逐渐失去优势。投资人与他采用同股同权，使得王石的投票权与投资人相同，无法有效控制公司。

“万宝之争”：

2016年，宝能要求罢免万科现任管理层，虽然遭到反对，但这场斗争对王石和万科都产生了深远影响。2017年，恒大集团转让股权，深圳地铁成为万科最大股东，王石因此出局。

管理层挤兑：

王石在万科的管理层中受到一致挤兑，最终选择离开万科。

个人选择：

王石在宣布退休时提到，他从当初放弃股权的那一刻起，万科就走上了一条混合所有制道路，成为一个集体的作品。他决定不再作为万科董事被提名，将接力棒交给郁亮。

综合以上原因，王石的离开是多种因素共同作用的结果，包括股权布局失误、激烈的公司内部斗争以及个人职业规划等。尽管他离开了万科董事长的职位，但他仍然在商界和其他领域保持着影响力。