王石被踢出万科的原因是多方面的，主要包括以下几点：

股权结构变化：

王石在1988年放弃了万科的股份，希望建立一支完全由职业经理人组成的团队。随着公司的发展，股权结构发生变化，特别是宝能集团入股后，引发了股东之间的权力斗争。王石作为创始人希望保持公司的独立性和管理权，而资本方则希望对管理层施加更多的影响。

管理风格与决策：

王石的管理风格中个人主义色彩较浓，有时与公司高层产生分歧，影响了决策效率和团队凝聚力。同时，他在战略调整上表现保守，未能及时适应房地产市场的变化。

年轻管理团队培养不足：

王石在培养年轻一代管理团队方面存在不足，这在公司面临市场竞争和变革时造成了人才储备的缺乏。

个人形象问题：

王石的一些公共言论和行为引发了社会广泛关注和争议，对万科的品牌形象造成了一定影响。

企业治理结构问题：

万科作为上市公司，没有实施有效的股权激励措施，导致在资本市场上遇到了野蛮人入侵，例如宝能集团的姚振华通过不断增资成为万科第一大股东，最终引发了万宝之争。

控制权问题：

万科的股权稀释过多，王石失去了对公司的控制权，特别是在同股同权没有进行有效分割的情况下。

综上所述，王石被踢出局的原因主要是由于他在公司管理中的个人主义色彩过浓、对公司战略的调整不够及时、对年轻一代管理团队的培养不足以及个人形象问题等多方面原因。此外，股权结构的变化和资本方的介入也是导致他离开的重要原因。尽管如此，王石依然在商界有其他成就，并未完全退出商业舞台。