保护民族自决权的原因主要有以下几点：

国家主权的基础

民族自决权是国家主权的基础。一个国家的独立和主权是民族自决权的前提和保障。没有国家主权，民族自决权就失去了基础和保障。同时，民族自决权的行使也必须以国家主权为前提，不得损害国家的主权和利益。

国际法的体现

民族自决权的内容包括两个方面：对于受殖民统治或外国军事侵略和占领下的民族来说，民族自决权就是摆脱殖民统治，建立或恢复独立的主权国家的权利。对于已经建立独立国家的民族整体来说，作为其组成部分的少数民族不存在这种意义上的民族自决权，他们享有的是属于国家主权范围内的民族自治权利。

《联合国宪章》作为国际法的重要基石，旨在维护国际和平与安全、促进国际合作与发展，其序言中明确提到“重申基本人权，人格尊严与价值，以及男女与大小各国平等权利之信念”，并强调“发展友好关系，以增强普遍和平”。

平等和公正

民族自决权的行使必须符合国际法和相关国家的规定，必须符合平等、公正、透明等原则，不得损害其他国家和民族的利益。同时，民族自决权的行使也必须尊重历史和现实，不得违反历史和现实。

国家发展战略

民族自决权的行使必须与国家的发展战略和目标相一致。民族自决权的行使必须以国家的发展战略和目标为基础，不得损害国家的发展战略和目标。同时，民族自决权的行使也必须与国际社会的发展趋势相一致，不得损害国际社会的利益。

民族区域自治

民族区域自治制度是在国家统一领导下，各少数民族聚居的地方实行区域自治，设立自治机关，行使自治权的制度。这一制度体现了国家坚持实行各民族平等、团结和共同繁荣的原则，通过《宪法》和相关法律规定予以保障。

综上所述，保护民族自决权是为了维护国家的独立和主权，促进国际和平与发展，保障各民族的平等和公正，以及实现国家的发展战略和目标。