保护农业生态环境需要采取一系列综合性的措施，主要包括以下几个方面：

科学合理的土地利用规划：

通过合理规划和区分利用土地种类，确保农业生产与生态环境的协调发展。保护农田、湿地、森林等生态脆弱区域，避免大规模土地开垦和大型农业项目的建设，减少生态环境的破坏。

推广有机农业和绿色农业：

有机农业和绿色农业能够有效减少农业生产对生态环境的负面影响。不使用化学农药和化肥，注重生态平衡和自然循环，从而保护土壤质量和农田生态系统。政府应加大政策支持和宣传力度，推动农民转变观念，鼓励采用环保的农业生产模式。

加强农药和化肥的管理：

不合理使用农药和化肥是导致农田生态环境污染的重要原因。应加强对其在生产、销售和使用过程中的管理，建立健全的登记、检测、使用审批机制，严格限制使用量和剂量，对违规使用者进行处罚，保护土壤、水体和空气的质量。

推广节水农业技术：

水资源是农业生态环境的重要组成部分，节约和合理利用水资源对保护农业生态环境至关重要。可以采用滴灌、雨水收集和生态灌溉等技术，减少农田的耗水量。同时，培养农民节约用水的意识，加强对节水农业技术的培训和推广。

土壤保护：

合理利用农药和化肥，避免过度使用，减少对土壤的污染。推广有机农业和生态农业模式，减少对土壤的破坏。加强土壤保水保肥措施，如合理轮作、绿肥种植和有机质施用等，提高土壤质量和保护农田生态系统的稳定性。

水资源保护：

农业灌溉的水资源管理应采取节水技术和管理措施，如滴灌、雨水收集和灌溉系统的自动化控制，减少水的浪费和污染。同时，加强农业面源污染的防治，提高农田肥料和农药的利用率，减少对水体的污染。

植物保护：

加强对农作物病虫害的防治，减少化学农药的使用量。通过合理的轮作和间套种植等措施，减少病虫害的传播和发生。同时，加强对抗生素和农药残留的监管，确保农产品的质量和安全。

生物多样性保护：

保护和恢复农田周围的自然植被、湿地等生境，合理规划农田，保留生态廊道和农田间的生态过渡带。推广利用生物农药和生物防治技术，减少化学农药对生物多样性的负面影响。

农畜禽粪便和农膜处理：

采用科学的养殖管理措施，建立环保牧场，优化饲料配方，减少粪便产生的污染。同时，加强农膜回收利用，减少农膜对环境的污染。

政府监管和法律法规：

强化政府对农村生态环境的监管和法规制定，对环境污染者进行严格处罚，保障环境权益。通过法律、经济、技术和教育手段，协调社会和农业经济发展的关系，防止农业环境污染和保护农业生态平衡。

通过这些措施的实施，可以有效保护和改善农业生态环境，促进农业的可持续发展。