表示感谢员工辛苦付出的成语有很多，以下是一些常用的成语：

感激涕零：

感激得流泪，形容极为感动的样子。

感激不尽：

形容因受对方好处而极为感动。

感恩戴德：

感激别人的恩惠和好处，并推崇这种恩德。

感恩图报：

感激别人的恩情而想办法回报。

千恩万谢：

一再表示感恩和谢意。

结草衔环：

旧时比喻感恩报德，至死不忘。

感同身受：

心里很感激，就像自己亲身感受到恩惠一样。

恩重如山：

形容恩情像山一样厚重。

恩若再生：

形容恩情如同再生一般。

恩山义海：

形容恩情像海一样深广。

滴水之恩，涌泉相报：

形容受到一点恩惠就要加倍（在行动上）报答。

没齿难忘：

一辈子也忘不了。

铭感不忘：

铭刻在心灵深处，永远不会忘记。

知恩报恩：

对于别人给予的恩情要知道回报。

以德报怨：

用恩德来回报怨恨。

含辛茹苦：

形容经受过艰辛困苦。

艰苦奋斗：

形容在困难的环境中坚持奋斗。

勤勤恳恳：

形容勤劳、踏实。

兢兢业业：

形容做事小心谨慎，认真踏实。

夜以继日：

形容日夜不停地工作或学习。

这些成语都可以用来表达对员工辛苦付出的感激之情。根据具体情境选择合适的成语，可以更准确地传达你的谢意。