当女生说男生“长的斯斯文文的很干净”时，通常包含以下几层含义：

有礼貌和涵养：

斯文可以理解为有礼貌、有涵养，表现出一种温文尔雅的气质。

外表整洁清秀：

斯文干净通常用来形容男生长相文质彬彬，白白净净，给人一种清爽、舒适的感觉。

性格温和不张扬：

斯文的男生往往性格较为温和，不张扬跋扈，举止落落大方，谦和不失礼貌。

没有不良习惯：

这个评价也可能暗示男生有良好的卫生习惯，穿着整洁干净，没有不良嗜好或行为。

内心善良：

真正的干净不仅仅是外表的整洁，更体现在内在的善良和外在表现的一致性上。

综合来看，女生说男生“长的斯斯文文的很干净”是一种综合了外貌、气质和内在品质的赞美，表明她对这个男生有好感和认可。这种评价通常带有一种欣赏和喜欢的情感色彩。