事业单位医生的加班费计算方式主要依据《工资支付暂行规定》以及《事业单位人事管理条例》等相关法律法规。以下是具体的计算步骤和要点：

工作日加班

如果在工作日延长工作时间，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付工资。

休息日加班

如果在工作日之外的休息日加班且未安排补休，则应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付工资。

法定节假日加班

如果在法定节假日加班，则应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资。

工资基数

加班费的计算基数通常为劳动者的月工资收入，但在实际操作中，有些单位可能会根据具体情况有所调整。需要注意的是，加班费的计算基数不应低于当地最低工资标准。

工资折算

计算加班费时，首先需要将劳动者的月工资收入折算为小时工资，即日工资=月工资收入÷21.75天，小时工资=日工资÷8小时。

综合计算

对于实行综合计算工时制度的单位，如果综合计算工作时间超过法定标准工作时间的部分，也应按照上述标准支付加班费。

综上所述，事业单位医生的加班费计算较为明确，主要依据加班时间（工作日、休息日或法定节假日）和工资基数来确定具体的加班工资数额。建议在实际计算加班费时，参照最新的法律法规，并与单位的人事或财务部门进行确认，以确保计算的准确性和合法性。