《奇蛋物语》的结局是开放式的。该剧在播出过程中留下了许多伏笔，给观众留下了想象的空间。虽然官方在2021年6月29日放送了特别篇，但这并不构成最终集，而是对故事内容的进一步扩展和补充。特别篇中揭示了一些关键信息，例如音瑠可能去了一个特殊的世界，而其他角色的命运也发生了变化。此外，有观点认为，《奇蛋物语》可能会像《东京残响》一样，有一个开放式的结局，而不是一个明确的结局。因此，可以推测《奇蛋物语》的结局是留给观众去想象和解读的。