清明时节雨纷纷的原因主要可以归结为以下几点：

气流交汇：

清明时节，北方的冷气团与南方的暖湿气团在江南地区频繁交汇，形成气象学上的锋面。暖湿气团被冷空气抬升，在上升过程中温度不断降低，其中的水汽逐渐凝结并形成大量水滴，最终降落至地面成为降雨。

低气压系统：

春季是大气环流变化最为剧烈的季节之一，常常会出现一些低气压系统。这些低气压系统会带来阴雨天气和雷雨天气，因为低气压意味着大气压力的降低，导致空气上升运动增强，云量增多，降水概率也随之增大。

水汽含量增加：

清明时节大气层里的水汽含量较高，且昼夜温差较大。白天，太阳照射使地表温度上升，水汽蒸发加剧；夜晚，地表温度迅速下降，水汽容易凝结成露水或雨滴。这种大气温差导致的水汽凝结和降水形成，也是清明时节多雨的一个重要因素。

植被蒸腾作用：

春季是植物开始萌发的季节，随着植被的增加，大气层中的水汽含量也会相应增加。植被通过蒸腾作用释放大量水汽到大气中，进一步为雨水的形成提供了条件。

季风影响：

清明时节，受季风影响，我国南方地区阴雨天气较多。季风带来了温暖潮湿的空气，与冷空气相遇后形成降雨。

综上所述，清明时节雨纷纷的原因是多方面的，包括气流交汇、低气压系统的频繁出现、大气层水汽含量的增加以及昼夜温差的作用。这些因素相互作用，共同导致了清明时节多雨的气候特点。