在《三生三世枕上书》中，东华帝君最终知道了小白（白凤九）的真实身份。在剧情中，东华帝君带白凤九出阿兰若之梦，沉晔（小白的另一身份）知晓自己就是帝君的一缕影子，东华帝君也知道了阿兰若其实是小白为了报恩投下的自己的影子。因此，东华帝君对小白的怜爱更甚，并炼了改变小白记忆的丹药，让小白以为自己已经和他成婚。

此外，在剧情的后期，东华帝君在小白的兵藏之礼因着魔君聂初寅，不得已以小白夫君的身份出现在大家面前，并诳小白让她安心等着大婚，带小白去碧海苍穹游玩，他们商量着婚后该住哪里，家里要怎么装修，花园要怎么设计，生几个孩子，帝君还带小白去看百鸟朝凤，小白为他跳舞等等。

因此，可以确定东华帝君在剧情的某个阶段知道了小白的真实身份，并且对小白产生了深厚的感情。