自来也死在 《火影忍者》TV版的第353集，这一集的名字是“自来也豪杰物语”。

在这一集中，自来也为了调查晓组织的秘密来到了雨忍村，发现自己的徒弟长门就是晓组织的首领。自来也决定打败长门，但不了解佩恩六道的能力，一直处于下风。最终，自来也通灵出九尾狐，与佩恩六道展开了激战。尽管自来也的力量得到了提升，并且想出了一个对付佩恩的方法，但无奈忍术在轮回眼的监视下仍然无法发挥任何效用，最终被佩恩六道杀死。

在临死前，自来也明白了佩恩六道及其本体的秘密，并将信息加密传了出去。尽管后来无数人被秽土转生复活，但其中并没有自来也的存在。