佩恩和半藏都是《火影忍者》中的强大角色，但根据剧情和资料，佩恩的实力在多个方面都超过了半藏。

佩恩的实力

佩恩拥有轮回眼，这是他的核心力量来源。轮回眼不仅赋予了他强大的战斗力，还让他能够使用六道仙人的各种能力，如六道阳之力、六道阴之力、六道仙人的力量等。

在剧情中，佩恩曾一人对抗木叶三忍（自来也、纲手、大蛇丸），并且取得了胜利。

佩恩的六道模式可以同时操控六个尸体，并且这些尸体可以共享视野和协同作战，这大大增强了他的战斗力。

半藏的实力

半藏曾经是雨隐村的领袖，被誉为“半神”。

半藏擅长使用毒气和通灵术，尤其是他的毒气对普通忍者来说是致命的，但对佩恩无效，因为佩恩是尸体，对毒性有免疫。

半藏在年轻时候非常强大，曾一人对抗木叶三忍，并且给了他们很大的压力，但最终还是败给了他们。

对比分析

战斗力：佩恩拥有轮回眼和六道模式，战斗力远超半藏。即使是巅峰时期的半藏，也无法击败拥有轮回眼的佩恩。

战斗经验：佩恩在剧情中多次展示出强大的战斗力和策略，而半藏在面对佩恩时，已经处于职业生涯的晚期，战斗力大打折扣。

特殊能力：佩恩的六道模式让他能够同时操控六个尸体，这种能力在战斗中是半藏无法比拟的。

综上所述，佩恩的实力在多个方面都超过了半藏，尤其是在拥有轮回眼和六道模式的情况下，佩恩的战斗力是远远超过半藏的。因此，佩恩更厉害。