“明明爱着，偏偏要表现的不太明显，未能如愿，却沾染了你很多的习惯”这句话表达了一种 深情而又无奈的爱情状态。具体来说，它包含了以下几个层面的含义：

深情的暗恋：

句子中的“明明爱着”表明主人公内心深处的感情是强烈而真挚的，但这种爱并没有通过直接的方式表达出来，而是显得含蓄而隐秘。

无奈的爱情：

主人公“偏偏要表现的不太明显”，暗示了他在爱情面前有些无奈，可能是因为害怕被拒绝、担心关系破裂或者其他原因，导致他无法坦诚地表达自己的感情。

习惯的力量：

尽管爱情未能如愿，主人公却在不知不觉中“沾染了你很多的习惯”，这说明他在日常生活中已经深深地受到了对方的影响，这种影响甚至超越了理智的层面，成为了他生活中的一部分。

遗憾和思念：

句子中透露出一种对未能如愿的遗憾和对对方的深深思念，这种情感在“未能如愿，却沾染了你很多的习惯”中得到了充分的体现。

综合来看，这句话描绘了一种复杂而微妙的爱情状态，主人公在深爱着对方的同时，却因为种种原因无法坦诚相待，这种爱情充满了无奈和遗憾，但又无法割舍。